První sezóna začíná tam, kde minisérie skončila. Po prohrané bitvě se Cylony jsou poslední zbytky lidstva nuceny uprchnout pod ochranu jediné zbývající válečné lodi, zastaralé Battlestar Galactica. Pronásledováni Cylony - z nichž někteří nyní přijali lidskou podobu - vedou komandér Adama a prezidentka Roslinová tyto poslední zbytky lidstva při hledání nového domova - planety zvané Země.