Shadowverse Flame presenta a un nuevo protagonista, Light Tenryu, y su historia se desarrolla en Shadovar College, una instalación que entrena a jugadores profesionales del juego Shadowverse. Tenryu Light, un estudiante transferido, decide unirse a "Seventh Flame", uno de los siete clubes de Shadovar. ¡Sin embargo, Seventh Flame está a punto de cerrar debido a la falta de miembros! Para evitar la desaparición del club, Light decide buscar nuevos miembros. Pero lo que le espera son poderosos rivales que controlan una gran variedad de cartas...