Saya Otonashi, cierpiąca na anemię i amnezję, znajduje się pod opieką rodziny zastępczej i jest zwykłą uczennicą. Życie Sayi zostaje jednak zniszczone, gdy zostaje zaatakowana przez Chiropterana – nietoperzopodobną bestię żywiącą się ludzką krwią, dowiaduje się ona również, że tylko ona jest w stanie zabić te bestie. Saya, wyposażona w miecz wyrusza z rodziną, sojusznikami z organizacji Red Shield (Czerwona Tarcza) i Chevalier'em (kawalerzystą), Haji'm, w podróż po świecie, aby zniszczyć Chiropteran i odnaleźć swoją przeszłość.