L’Agente Claire Bennigan sta indagando su una bimba di sei anni che ha tentato di uccidere la madre e capisce che una persona misteriosa di nome Drill sta manipolando i bambini. Nel frattempo, l'agente del Dipartimento della Difesa Wes Lawrence è inviato nel deserto del Sahara dove un F22 scomparso, pilotato da Sean - marito di Claire - si è incagliato in una strana struttura di origine aliena.